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基因


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进行改造

将经过基因改造的细菌重新引入其自然环境难度极大——这种方法仅限于无菌动物模型,或需使用抗生素处理动物以促进工程菌定植,而这两种方式都会破坏肠道内原有的微生物群。
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编辑疗法

研究计划于明年启动,此前组织者已花费数月时间与美国监管机构谈判,旨在简化基因编辑疗法进入试验前通常必须经过的复杂程序。
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除了计划在费城进行的临床试验外,今年7月在美国加州大学伯克利分校和加州大学旧金山分校成立的儿科CRISPR治疗中心,也致力于开发个性化基因编辑疗法。
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最终诞生了一个世界首创——一种为单个人量身定制的尖端基因编辑疗法,并在破纪录的6个月内研发完成。
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编辑

目前,使用MetaEdit技术仍需克服一些障碍,例如:接合作用的效率、基因编辑对细菌宿主适应性的影响,以及设计目标物种特异性载体的需求。
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但Montgomery承认,使用基因编辑最少的猪器官的有效性,仍需在脑死亡和活体人类身上进一步实验验证。
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此前他们曾将同种基因编辑的肾脏移植给一名活体受者,但因其之前患有心力衰竭,移植在两个月内失败。
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一种基因编辑方法可对小鼠肠道内的细菌进行改造一种基因编辑方法可对小鼠肠道内的细菌进行改造精选
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一种基因编辑方法可对小鼠肠道内的细菌进行改造数十年来,微生物学家一直面临一个难题:若要真正了解一种肠道细菌,就必须在其天然生态系统中对其进行研究;
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利用MetaEdit工具对小鼠肠道细菌进行基因编辑
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利用MetaEdit工具对小鼠肠道细菌进行基因编辑宏基因组编辑技术(MetaEdit)可在小鼠肠道内直接对细菌进行基因改造,包括此前无法进行基因编辑的不可培养细菌。
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基因组编辑技术(MetaEdit)可在小鼠肠道内直接对细菌进行基因改造,包括此前无法进行基因编辑的不可培养细菌。
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突变会导致精神疾病

特定单基因突变会导致精神疾病
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猪器官

过去3年间,约有十余名活体受者接受了转基因猪器官移植,包括心脏、肾脏、肝脏及胸腺。
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沉默

慕尼黑工业大学的计算生物学家法比安·泰斯(FabianTheis)补充道,这些模型无法解答研究者最关心的许多问题:“可以说,它们在某些预测任务上完全失败了”,例如预测基因沉默的效果。
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数据

参赛者需用其中150个基因的数据(以及他们能找到的其他同类细胞数据)训练模型;
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最终排名则取决于模型对剩余100个基因数据的预测表现。
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效果

在预赛阶段,需预测沉默另外50个基因的效果——结果会公布在赛事排行榜上,参赛者可据此优化模型;
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团队用近3000万个人类细胞的基因活性数据训练Geneformer,发现它能推断基因间的相互作用,并预测干扰特定基因的效果。
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改造

值得注意的是,研究人员还实现了对分节丝状菌(segmentedfilamentousbacteria)的基因改造——这类细菌参与免疫调节,但由于其会附着在肠道上皮细胞上,极难在培养环境中生长(参考文献7)。
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格尔辛格等人观察到,经编辑的细菌通常在5-10天后从小鼠肠道中消失。
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此外,肠道微生物中仅有一小部分易于在培养环境中生长,且能够进行基因改造。
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通过调控特定营养物质的可利用性,可调节经基因改造细菌的丰度。
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基因

GRIN2A基因在调节神经细胞的电兴奋性中起着核心作用。
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在此次研究中,研究团队对121名GRIN2A基因发生遗传变异的个体数据进行了统计分析。
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研究结果表明,GRIN2A是已知第一个单独引起精神疾病的基因
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展望未来,MetaEdit技术可用于在天然环境中系统探究细菌基因的功能:通过向导RNA库或载体库,开展高通量的功能缺失或功能获得研究。
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表观遗传修饰:DNA甲基化、组蛋白乙酰化等表观遗传改变,影响HER2及相关信号通路基因的表达;
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gov),首次系统解析了人体中1900余种编码分泌蛋白的基因在肿瘤免疫微环境中的调控作用。
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不过,该技术在肠道内直接编辑微生物基因组的递送效率,通常远低于其他方法。
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类风湿性关节炎基因治疗研究取得新进展
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近日,吉林大学生命科学学院教授李全顺、副教授韩浩博团队,针对类风湿性关节炎异常激活的糖酵解信号通路,构建了上游为HSP70热响应启动子的血红素单加氧酶-1(HO-1)基因元件,通过近红外光驱动模式实现了该基因在病变关节组织中的精准表达,并通过对底盘滑膜细胞表型的调控及炎症微环境的重塑,在类风湿性关节炎基因治疗方面取得了良好的效果。
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基因疗法虽具潜力,但健康组织中基因的非特异性表达限制了其疗效与安全性。
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在本期杂志第696页,格尔辛格等人(参考文献4)介绍了“宏基因组编辑技术”(MetaEdit),该技术可在小鼠肠道环境中,将大片段DNA序列(即“DNA载体”)定向插入细菌基因组(见图)。
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由于复制型质粒可能会随时间推移而丢失(尤其当质粒无法为宿主细菌带来优势时),格尔辛格等人采用CRISPR相关转座酶(CAST)系统,将DNA载体整合到细菌基因组中,以确保其稳定且高效表达。
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近年来,一些原位微生物组编辑方法通过温和噬菌体向目标细菌递送新DNA——温和噬菌体是一类感染细菌的病毒,感染后不会立即杀死宿主细菌(参考文献3、5)。
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交换

然而,一项临床试验发现,经改造的普通福赛斯坦纳菌与其他肠道细菌之间的基因交换和重组事件,可能导致期望的治疗效果与利用补充多糖的能力脱节——这为未来的治疗方法提供了警示(参考文献9)。
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GRIN2A

科技日报北京11月17日电(记者刘霞)德国莱比锡大学科学家主导的一项国际研究首次证明,单个基因GRIN2A的突变会导致精神疾病。
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效果

多数猪器官来自经至少10项基因改造以降低排斥风险的供体猪。
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一项研究为解释这个现象提供了启发:果蝇实验表明,高糖饮食会影响它们感知甜味的味觉细胞的基因表达,造成持续的影响,这可能促使它们维持这种不健康的高糖饮食模式。
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然而,一项临床试验发现,经改造的普通福赛斯坦纳菌与其他肠道细菌之间的基因交换和重组事件,可能导致期望的治疗效果与利用补充多糖的能力脱节——这为未来的治疗方法提供了警示(参考文献9)。
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在过去一年中,与eGenesis以及其他两家公司Revivicor和ClonOrganBiotechnology合作的学术团队,通过基因编辑猪肾和改进的免疫抑制药物,推动了人类异种移植的进展。
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但是,基因编辑和他为耐受肾脏而服用的强效免疫抑制剂显然不足以阻止身体对器官的排斥。
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在一项相关研究中(参考文献10),研究人员在大肠杆菌中使用CAST系统,破坏了志贺毒素基因,同时插入了一个可表达纳米抗体(一种小型抗体)的基因——该纳米抗体可抑制未经改造的致病性大肠杆菌与肠道上皮细胞的结合。
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结果发现,沉默任一基因都能增强细胞的收缩能力,这表明抑制这些基因功能的药物可能对人类患者有益。
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影响

结果发现,沉默任一基因都能增强细胞的收缩能力,这表明抑制这些基因功能的药物可能对人类患者有益。
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然而,一项临床试验发现,经改造的普通福赛斯坦纳菌与其他肠道细菌之间的基因交换和重组事件,可能导致期望的治疗效果与利用补充多糖的能力脱节——这为未来的治疗方法提供了警示(参考文献9)。
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团队用近3000万个人类细胞的基因活性数据训练Geneformer,发现它能推断基因间的相互作用,并预测干扰特定基因的效果。
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GRIN2A基因在调节神经细胞的电兴奋性中起着核心作用。
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:不同基因的两个突变在同一信号通路中产生拮抗作用,从而共同决定最终表型。
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