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蛋白质结构


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即便是对于最难的随机蛋白质结构预测,AlphaFold也达了87.0GDT的高分。
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AlphaFold的得分可以说是在蛋白质结构的预测上达到了极高的准确性。
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CASP(CriticalAssessmentofproteinStructurePrediction)是国际性的蛋白质结构预测的重要评估组织,每两年进行一次蛋白质结构预测的全球试验比赛,主要目标是帮助推进从氨基酸序列中识别蛋白质三维结构的方法,被许多人认为是该科学领域的“黄金标准”。
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本周CASP表示DeepMind的AlphaFold系统在蛋白质结构预测方面取得了空前的准确性,GDT(GlobalDistanceTest)准确性高于90%。
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蛋白质结构

从氨基酸序列预测蛋白质结构变化的能力将对生命科学及医学领域带来巨大好处,德国马克斯·普朗克发展生物学研究所的进化生物学家安德烈·卢帕斯直言:“AlphaFold帮助他解决了困扰十几年的难题,通常情况下,破解一个蛋白质的结构需要耗费数年时间,而现在,几天之内就能得到一个非常接近的结构,这无疑会极大加速对细胞组成部分的工作,也将改变我的工作方式”。
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氨基酸序列准确预测蛋白质结构的能力将对生命科学和医学带来巨大的好处。
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不过这并不代表计算机退出了舞台,相反,来自马里兰大学学院公园分校的计算生物学家约翰·穆尔特与其他人共同创立了CASP,致力于改进精确预测蛋白质结构的计算方法。
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