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蛋白


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运输工具

研究基于转铁蛋白运输工具的人员正在关注其他潜在目标疾病,如溶酶体贮积症、神经退行性疾病,以及某些以治疗性抗体为标准疗法的癌症。
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过敏原

研究团队推测,其他含有成孔蛋白的过敏原也会诱发免疫反应。
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蛋白

例如,10月初,毛志勇及其团队发表的研究[2]指出,裸鼹鼠(一种啮齿动物)的寿命可超过30年(对啮齿类而言已是非凡成就),其体内同样含有一种功能增强的DNA修复蛋白
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这会激活大约1000个基因,并引发大量抗病毒蛋白的产生。
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小鼠实验显示,阻断AGPAT4蛋白能减缓肿瘤生长速度,并提高药物索拉非尼(一种常用肝癌靶向药)的治疗效果。
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这类代谢途径涉及一款名为AGPAT4的蛋白,它在胚胎干细胞和肝细胞癌肿瘤细胞中被大量表达,但在正常组织中比较罕见。
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马桂宜续指,研究数据显示,AGPAT4蛋白就像开关,可增强癌细胞的灵活性和侵略性。
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研究发现,植物中的NRT1.1B蛋白就像一个“智能开关”,能同时感知土壤中的氮营养状态和逆境信号,并根据环境变化指挥植物做出最优选择,实现对复杂环境的适应。
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他说,这些结果于7月发表在《自然-生物医学工程》杂志上,为mRNA疫苗可以促进癌症免疫治疗的想法“真正奠定了基础”,即使mRNA疫苗不针对任何特定肿瘤蛋白
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本研究通过分析169例临床样本,发现在肺癌中高表达的FRMD6蛋白通过促进mTOR与S6K的相互作用,激活mTOR信号通路,从而驱动肺癌细胞增殖、迁移和肿瘤进展。
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进一步对169例肺癌患者(75例LUSC和94例LUAD)的组织样本进行免疫组化(IHC)检测,证实FRMD6蛋白在LUAD和LUSC中高表达,阳性率分别为72.34%和48%,且高表达与T分期(肿瘤大小)、N分期(淋巴结转移)显著相关,预示更差的生存率。
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图3FRMD6与mTOR信号通路蛋白相互作用
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细胞外线粒体蛋白(ex-mtprot):指示与年龄相关的疾病
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标准化定量:qPCR检测ex-mtDNA,流式细胞术分析线粒体蛋白
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与单一人类蛋白质相互作用的病毒蛋白质分布
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单个人类蛋白质与多种病毒蛋白质的相互作用及其分布图
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图3与单个人类蛋白质相互作用的病毒蛋白质的分布
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图4病毒蛋白与单个人类蛋白相互作用的线性分布
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病毒与宿主蛋白相互作用多发生在特定功能背景下,且通常遵循1:1的比例,但部分人类蛋白可被多种病毒蛋白共同靶向,提示病毒可能通过模拟宿主结构基序实现入侵。
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病毒并不直接攻击细胞代谢关键机制,而是通过多种病毒蛋白靶向由重要人类蛋白主导的蛋白质复合物,尤其是核糖体系统,以控制蛋白质生物合成等过程。
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病毒蛋白(包括非结构蛋白和附属蛋白)通过域-基序相互作用模拟宿主结合界面,并利用其内在无序区(约47%)增强攻击灵活性。
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该研究通过分析人类肝脏蛋白质与病毒蛋白质的相互作用数据,发现多个病毒蛋白可靶向特定人类蛋白,其中核糖体蛋白是最主要目标。
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Gao等人观察到,辅助性T细胞17(TH17细胞,CD4+T细胞的一个亚群)会表达Aster-A蛋白——该蛋白参与细胞内胆固醇的非囊泡转运,负责将胆固醇从细胞膜转运到内质网[8]。
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免疫细胞中Aster-A蛋白的缺失会抑制脂质吸收,并保护小鼠免受饮食诱导的肥胖及其相关后果(包括脂肪组织炎症和脂肪肝)的影响。
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高(Gao)等人发现,在小鼠体内特异性敲除T细胞中的Aster-A蛋白,可抑制其对膳食脂肪的摄取,并预防饮食诱导的肥胖(参见伯克哈特(Burkhardt)与埃克(Ecker)撰写的展望文章)。
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弓头鲸(*Balaenamysticetus*)的寿命可超过200年,这在一定程度上要归功于一种高效的DNA修复蛋白
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也成了我几年后洋插队到美国农村,研究蛋白的动力之一。
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这个蛋白居然有信号肽(应该有,蛋白就是分泌到细胞质外去水解目的分子,只是我想着尽快晚上老师交代的任务,忘记了仔细看看自己所研究的蛋白)。
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因此,睡眠剥夺的dFBNs中线粒体-内质网接触的丰富性(图3d)不仅可能反映了最近的线粒体分裂浪潮(图3a、b和扩展数据图5c-f),而且正如我们推测的编码线粒体蛋白的转录本的丰富性(图1c)那样,可能预示着在随后的恢复性睡眠期间线粒体的增殖和融合,这导致它们的体积、形状和分支长度反弹至基线以上(图3a、b和扩展数据图5e、f)。
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本文的其余部分探讨了dFBNs中编码线粒体蛋白的基因差异表达的原因和结果;
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标签标识定位于突触或线粒体的蛋白质产物;
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然而,编码线粒体蛋白的转录本上调是表明线粒体质量净增加,还是对细胞器损伤的代偿性反应,仍不明确。
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睡眠剥夺增加了自动检测到的线粒体轮廓内细胞抗Flag荧光(根据下方图例进行强度编码)的百分比(双侧Mann-Whitney检验,P<0.0001)。
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结合

GATOR2具有“无人机”状的结构主体,在八边形框架上延伸出动态的“螺旋桨”结构,这一框架可与营养素感知蛋白结合。
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要实现这一调控,GATOR2必须与营养素感知蛋白结合,例如感知亮氨酸的Sestrin2蛋白[4],以及感知精氨酸的CASTOR1蛋白[5]。
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b,为探索这一发现的治疗潜力,研究人员设计了一种可溶性“诱饵”蛋白:将LRP8中与E蛋白结合的区域与抗体片段融合。
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不过,仍有诸多问题有待解答:TBEV是否仅依赖LRP8入侵?
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纯化

信号肽-我的蛋白纯化漂流记信号肽-我的蛋白纯化漂流记精选
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本文就蛋白纯化(准确说是表达)中蒙杨老师指点,在我初入职场时,攻读学位中,乃至在咨询案例时都发挥了十分重要的一个知识点,与各位同行分享。
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相互作用

-与之相反,CASTOR1会重塑GATOR2“无人机”的结构,将其八边形框架转变为方形,并直接影响GATOR2与相关蛋白的相互作用——这些蛋白负责在GATOR2与mTORC1之间传递“营养需求”信号。
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测序报告

第二天早晨我迫不及待的冲进办公室,研究了一下该蛋白的测序报告。
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居然

含量

可如果你翻看传统的分子研究,就会发现一个有趣的现象:仅靠基因表达(转录组)或蛋白含量(蛋白质组)的差异,还不足以完全解释这些不同的适应。
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受体

其次,通过过表达或敲低等方式改变受体水平,应能调节细胞对病毒感染的敏感性;
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此外,LRP8还是Reelin蛋白的受体,Reelin是一种信号分子,在发育过程中可充当“GPS信号”,引导脑细胞到达正确位置⁠[7]。
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筛选结果中最显著的“命中基因”是编码细胞表面受体LRP8(低密度脂蛋白受体相关蛋白8,又称ApoER2,即载脂蛋白E受体2)的基因。
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分离

蛋白分离有点像艺术,很多的know-how书本上没有,或语焉不详,更依赖师门传承。
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入侵细胞

在蜱虫(自然储存宿主)或已知易感的家畜体内,TBEV是利用LRP8,还是结构或功能相似的蛋白入侵细胞?
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最后,LRP8是首个经过严格验证(包括动物模型验证)的黄病毒受体蛋白,这提示其他黄病毒可能也会利用LRP8相关的细胞表面蛋白入侵细胞,也可能依赖完全不同的蛋白
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入侵

作用

E蛋白的作用包括:帮助病毒与受体结合、通过囊泡进入宿主细胞,以及随后与囊泡膜融合——这一步骤由囊泡内的酸性环境触发。
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产生

乙酰化

研究发现,HIIT在12周后引发了大规模的线粒体蛋白乙酰化。
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LRP8

a,米特勒等人⁠[3]发现,细胞表面蛋白LRP8是TBEV(一种通过蜱虫传播给人类的黄病毒)入侵人类细胞的关键受体。
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而与正常表达LRP8的细胞相比,过表达LRP8的细胞对病毒感染更敏感。
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效果

今年4月公布的阿尔茨海默病治疗数据显示,罗氏开发的trontinemab抗体在部分受试者中,搭载递送系统的抗体清除淀粉样蛋白效率提升了3倍,用药剂量仅需常规疗法的五分之一,且显著降低了脑水肿风险。
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研究显示:通过转铁蛋白受体递送的寡核苷酸,覆盖了实验动物脑部广大区域,显著降低了目标蛋白水平。
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相较于广泛抑制整个mTORC1蛋白复合物,靶向这类特异性传感器可能会降低治疗对患者的毒性。
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免疫系统能感知到由成孔蛋白造成的细胞膜损伤,并发起免疫反应。
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清华大学研究免疫反应的共同作者徐墨表示,这些成孔蛋白对细胞膜造成的损伤可能是“我们的身体将某种物质识别为过敏原的一种常见信号”。
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戈尔曼解释说,细胞将外来蛋白质(如治疗性IDS)视为废物,并直接将其导向溶酶体,“这恰恰是理想的——因为替代酶正需要进入溶酶体”。
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这些工具能够运送包括抗体、蛋白质和基因治疗用病毒在内的大型生物药物,有望彻底革新神经药理学,不仅适用于亨特综合征等罕见病,还可用于癌症、阿尔茨海默病和其他常见脑部疾病。
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研究人员必须确保它不会干扰转铁蛋白受体的正常功能,不会被困在内皮细胞中,且所运输的治疗剂到达靶点后仍能发挥作用。
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过去四年中,美国食品药品监督管理局(FDA)批准了几种靶向淀粉样蛋白(阿尔茨海默病患者大脑斑块的主要成分)的抗体药物。
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然而,对于大型生物药物(如一些抗体、蛋白质或基因治疗载体等),血脑屏障则成了难以逾越的障碍。
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这些精妙的“运输工具”能够突破血脑屏障,将抗体、蛋白质乃至基因治疗所需的生物药物精准送达大脑。
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这些蛋白的作用方式各异,有些阻止病毒进入细胞,有些则抑制新病毒颗粒的释放。
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例如,寡核苷酸(可调节基因或蛋白质表达的短链RNA或DNA分子)可被设计为抑制致病蛋白的转录。
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a,米特勒等人⁠[3]发现,细胞表面蛋白LRP8是TBEV(一种通过蜱虫传播给人类的黄病毒)入侵人类细胞的关键受体。
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它能否利用其他受体感染不同类型的易感细胞(如脑细胞、皮肤细胞、免疫细胞和血管细胞)?
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这种诱饵蛋白可阻止实验室培养的人类脑细胞被感染,并能保护小鼠(图中未显示)免受致命剂量TBEV的攻击。
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阻断E蛋白与LRP8的相互作用能否阻止TBEV感染?
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研究团队还观察到,当每三天给小鼠施用一次这些蛋白质、持续两周后,小鼠出现了呼吸道过敏的迹象,比如血清中免疫球蛋白E(一种应对过敏原产生的抗体)水平升高。
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影响

-与之相反,CASTOR1会重塑GATOR2“无人机”的结构,将其八边形框架转变为方形,并直接影响GATOR2与相关蛋白的相互作用——这些蛋白负责在GATOR2与mTORC1之间传递“营养需求”信号。
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a,米特勒等人⁠[3]发现,细胞表面蛋白LRP8是TBEV(一种通过蜱虫传播给人类的黄病毒)入侵人类细胞的关键受体。
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研究人员必须确保它不会干扰转铁蛋白受体的正常功能,不会被困在内皮细胞中,且所运输的治疗剂到达靶点后仍能发挥作用。
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这些蛋白的作用方式各异,有些阻止病毒进入细胞,有些则抑制新病毒颗粒的释放。
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目前,科学家已明确两种营养素感知蛋白与GATOR2结合并改变其构象的作用机制。
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E蛋白的作用包括:帮助病毒与受体结合、通过囊泡进入宿主细胞,以及随后与囊泡膜融合——这一步骤由囊泡内的酸性环境触发。
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研究人员还通过蛋白质工程技术证实,LRP8可与TBEV的E蛋白直接结合,并定位出了二者相互作用的特定区域。
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