改造

值得注意的是，研究人员还实现了对分节丝状菌（segmentedfilamentousbacteria）的基因改造——这类细菌参与免疫调节，但由于其会附着在肠道上皮细胞上，极难在培养环境中生长（参考文献7）。

利用MetaEdit工具对小鼠肠道细菌进行基因编辑宏基因组编辑技术（MetaEdit）可在小鼠肠道内直接对细菌进行基因改造，包括此前无法进行基因编辑的不可培养细菌。

宏基因组编辑技术（MetaEdit）可在小鼠肠道内直接对细菌进行基因改造，包括此前无法进行基因编辑的不可培养细菌。

将经过基因改造的细菌重新引入其自然环境难度极大——这种方法仅限于无菌动物模型，或需使用抗生素处理动物以促进工程菌定植，而这两种方式都会破坏肠道内原有的微生物群。

格尔辛格等人观察到，经编辑的细菌通常在5-10天后从小鼠肠道中消失。

此外，肠道微生物中仅有一小部分易于在培养环境中生长，且能够进行基因改造。

通过调控特定营养物质的可利用性，可调节经基因改造细菌的丰度。